Bahagi ng pagkalito sa pagkamatay ni JonBenét Ramsey hindi nababahala hindi lamang ang mga pangyayari na nakapalibot sa kanyang pagkawala at pagtuklas, kundi pati na rin ang paraan ng kanyang pagkamatay mismo. Mayroong maraming mga kakaibang mga detalye tungkol sa kanyang pagpatay na gumawa ng maraming nagtataka kung ito ay itinanghal, o kung ang ilang mga aspeto ay inilaan upang masakop ang tunay na mamamatay. Siya ay pinatay noong Pasko noong 1996, sa anim na taong gulang lamang, at ang kanyang katawan ay natuklasan sa alak ng alak ng kanyang tahanan sa kabila ng isang natatawang tala ng natagpuan ng kanyang mga magulang na nagpapahiwatig na siya ay inagaw. Kaya, paano namatay si JonBenét Ramsey?
Ang punong pulis na si Mark Beckner, na nagtrabaho sa kaso ng Ramsey nang nangyari ito, ay gumawa ng isang Reddit AMA kung saan tinalakay niya ang mga detalye ng kaso. Ayon sa kanya, si JonBenét ay tinamaan sa ulo ng isang bagay na maaaring isang flashlight o isang katulad na bagay, na bumagsak sa kanyang bungo at kumatok sa kanyang walang malay. Apatnapu't limang minuto hanggang dalawang oras ang lumipas, siya ay hinagupit ng isang garrote na gawa sa isang kurdon at isang sirang pintura na kinuha mula sa bahay ng Ramsey. Ang pagkagulat ay kung ano ang pumatay sa kanya, sabi ni Beckner, ngunit ang suntok sa ulo ay papatayin siya sa kalaunan. Maaaring siya ay inatake ng sekswal, kahit na pinaniwala ni Chief Beckner na ang trauma sa kanyang mga maselang bahagi ng katawan ay naitala. Natagpuan din siya sa kanyang mga kamay na nakagapos at duct tape sa kanyang bibig. Mayroong DNA sa pinangyarihan, ngunit hindi ito tumugma sa alinman sa mga pinaghihinalaang pulis na itinuturing.
Mayroong iba pang mga kakaibang detalye. Bukod sa nasira na pintura, ang isa pang bahagi na natagpuan sa gitna ng mga suplay ng sining ni Patsy Ramsey, mayroong pinya na natagpuan sa tiyan ni JonBenét na siya ay naisip na sumakal sa loob lamang ng isang oras o dalawa bago siya namatay. Ni ang alinman sa kanyang mga magulang ay hindi nagbigay ng pagbibigay ng pinya ni JonBenét, ngunit mayroong isang mangkok ng pinya sa kusina. Ginagawa nitong mas nakakaganyak ang takbo ng oras - nais ba ng isang intruder na magkaroon ng oras upang mabigyan ng meryenda si JonBenét, magsulat ng isang dalawa at kalahating pahina ng tala ng pantubos (mayroong kahit isang potensyal na unang draft ng tala na natagpuan sa bahay), bludgeon JonBenét, at pagkatapos maghintay ng isang oras o higit pa upang kunin siya? Lahat nang hindi nag-iiwan ng isang fingerprint, o anumang tanda na ang bahay ay nasira?
Gayunpaman, ang pinangyarihan ng krimen ay potensyal din na nakompromiso ng napakaraming tao na pumasok sa bahay kaagad pagkatapos, kasama ang pamilya at mga kaibigan ng Ramseys. At ang mga bagong katibayan ay dumating din sa mga nakaraang taon. Sa palagay nila ngayon ay maaaring gumamit ang stun gun sa JonBenét, at mayroon ding dalawang natatanging mga kopya ng boot na natagpuan sa silong. Bilang karagdagan sa ito, mayroong dugo na natagpuan sa damit na panloob ni JonBenét mula sa gabi ng pagpatay na naglalaman ng DNA ng isang hindi kilalang tao. Ang DNA ay hindi naitugma sa sinuman sa umiiral na database ng pulisya o alinman sa mga suspek sa kaso. Hindi ito tumugma sa Ramseys, alinman.